در باغهای کیوتو راوی دختر جوانی است که از عشقی تراژیک که در دوران نوجوانی برایش رخ داده میگوید. از جنگ جهانی دوم و «راندال» که سخت او را دوست میداشت. راندال در جزیره یوجیمای ژاپن کشته میشود و کتابی به نام باغهای کیوتو را برایش به یادگار میگذارد که شرح حال باغهای مینیاتوری ژاپن است که نابودی آنها در دوران جنگ رخ میدهد: «پسر داییام را توی یوجیما کشتند. قبلاً بهت گفته بودم؟ آخرین نفری بود که در آن جزیره کشته شد. میگفتند بعد از آتش بس و بعد از انتقال باقی سربازها به بیمارستانها یا به کیسههای اجساد کشته شده، حین پاکسازی منطقه یا به قول خودشان عملیات پاکسازی.»
ماجرای خانواده «راندال» و زندگی «آلن» شخصیت اصلی داستان و خانوادهاش و صدمهای که جنگ به زندگی انسانها وارد میکند در این کتاب به زیبایی به تصویر کشیده شده است.
کتاب در کنار اتفاقاتی که روی میدهد به دوران بردگی سیاهان در آمریکا و تبعیض نژادی و فرار بردگان به خانه پدری راندال که استاد دانشگاه است نقب میزند و بر جذابیت آن میافزاید.
باغهای کیوتو در آمریکا چندین بار تجدید چاپ شد و جوایز متعددی را کسب کرده است.