این کتاب داستان دو شخصیت متفاوت است که در موازات یکدیگر حرکت میکنند. «کافکا» که پسری ۱۵ ساله است و به علت یک پیشگویی عجیب از خانه فرار میکند و آقای «ناکاتا»، پیرمرد آرام، مهربان و عجیبی که به علت اتفاقی شگفتانگیز در بچگی دچار نوعی عقبماندگی ذهنی شده است، اما حاصل این حادثه به دست آوردن توانایی صحبت با گربههاست! بخشی از داستان به کافکا و زندگی او میپردازد و بخش دیگر به آقای ناکاتا. رمان «کافکا در ساحل» در عین دوپارگی دارای وحدت مضمون است و تمام حوادث حتی کوچکترین و جزییترین آنها به هم مرتبط هستند.